看 GoAgent 控制台上的日志,问题似乎跟 SSL 的连接建立有关系。再把 Chrome 的「审查元素」功能打开,Console 里面一堆错误。随便挑了个页面试图打开,好了,这下清楚了,证书有问题。
其实问题很简单:GoAgent 仿冒的证书被占用啦。
官方其实也提到过这个事情:
因为 GAE 平台限制,没法支持真正的 ssl 加密,goagent 只能通过伪造证书的方式做到代理 ssl 加密的网站,这个证书就是用来欺骗浏览器的。GoAgent 实际上相当于一个「中间人」。当访问 HTTPS 站点时,就得采用 SSL 中间人攻击的类似方式,才能完成代理的工作。SSL 中间人攻击怎么弄?导入受信任的根证书,然后利用这个根证书签发的证书把内容拆开后重新组装、加密、封包,骗完甲方骗乙方,欺骗通讯双方。否则两端任何一方觉得这内容不对劲,SSL 传输就会失败。这其实也就是为什么必须要干掉 CNNIC 相关的根证书的原因。
如果升级的时候不把 certs 目录清空,就有可能会有部分站点对应的证书还是以前的老的、用旧的根证书签发出来的。GoAgent 客户端一看,噢,证书已经有了,就不再重新生成了。但 Chrome 觉得证书不对,于是 SSL 握手就被挡了。
解决办法很简单,每次升级 GoAgent 的时候,把 local/certs 目录删掉。或者干脆每次用新目录来升级好了。

